Ανθρώπινος Το Proteome Project (HPP) ξεκίνησε το 2010 μετά την επιτυχή ολοκλήρωση του Ανθρώπινος Genome Project (HGP) για αναγνώριση, χαρακτηρισμό και χαρτογράφηση ανθρώπινος πρωτεόμιο (ολόκληρο το σύνολο των πρωτεϊνών που εκφράζεται από το ανθρώπινος γονιδίωμα). Στη δέκατη επέτειό του, η HPP κυκλοφόρησε το πρώτο σχέδιο υψηλής αυστηρότητας που καλύπτει το 90.4% του ανθρώπινος πρωτεόμα. Ως κώδικας ζωής, αυτό το ορόσημο έχει πολύ σημαντικές επιπτώσεις ανθρώπινος υγείας και θεραπείας.
Ολοκληρώθηκε στο 2003, Ανθρώπινος Το Genome Project (HGP) ήταν μια διεθνής συνεργασία που δημιουργήθηκε το 1990 με στόχο τον εντοπισμό του πλήρους συνόλου ανθρώπινος γονίδια και να προσδιοριστεί η πλήρης αλληλουχία των βάσεων DNA στο ανθρώπινος γονιδίωμα. Στις 15 Ιανουαρίου 2001, η HGP είχε κυκλοφορήσει την αρχική ακολουθία και ανάλυση του ανθρώπινος γονιδίωμα. Προσδιορισμός, χαρακτηρισμός και χαρτογράφηση των ανθρώπινος το πρωτείωμα (ολόκληρο το συμπλήρωμα πρωτεϊνών που κωδικοποιούνται από το γονιδίωμα) ήταν το επόμενο λογικό βήμα. Επομένως, Ανθρώπινος Ο Οργανισμός Proteome (HUPO) ιδρύθηκε στις 9 Φεβρουαρίου 2001 για να προωθήσει την έρευνα πρωτεϊνικής. Στις 23 Σεπτεμβρίου 2010 κυκλοφόρησε επίσημα το HUPO Ανθρώπινος Proteome Project (HPP) με στόχο την προετοιμασία ενός σχεδίου του ανθρώπινος πρωτεόμα (1).
Η ανάλυση του ανθρώπινος γονιδίωμα προβλέπει περίπου 20,300 γονίδια που κωδικοποιούν πρωτεΐνες. Ολόκληρο το σύνολο των πρωτεϊνών που κωδικοποιούνται από αυτά τα γονίδια αποτελούν το «ανθρώπινος πρωτεόμη». Ανθρώπινος Το πρωτέωμα είναι πολύ μεγαλύτερο από το «ανθρώπινο γονιδίωμα», επειδή ένα γονίδιο μπορεί να εκφραστεί σε εύρος μορφών (πρωτεομορφές) ως αποτέλεσμα χημικών τροποποιήσεων κατά τη διάρκεια και μετά τη μετάφραση. Υπολογίζεται ότι ένα εκατομμύριο πρωτεομορφές μπορεί να συνυπάρχουν σε ένα μόνο άτομο. Το 2010, κατά την έναρξη του HPP, μόλις το 70% των πρωτεϊνών που προβλέφθηκαν από την ανάλυση γονιδιώματος αναγνωρίστηκαν. Η ατζέντα του έργου proteome ήταν να καλύψει αυτό το κενό γνώσης. Με την πρόοδο της τεχνολογίας, κατέστη δυνατός ο εντοπισμός και η ποσοτικοποίηση των πρωτεϊνών και των μορφών τους με μεγαλύτερη ακρίβεια. Ωστόσο, υπάρχει ένας καλός αριθμός πρωτεϊνών που λείπουν (πρωτεΐνες προβλεφθεί από την ανάλυση γονιδιώματος, αλλά ακόμα δεν έχει εντοπιστεί) (2,3). Το έργο είναι ακόμη σε εξέλιξη. Ωστόσο, έχει επιτευχθεί ένα ορόσημο.
Στις 16 Οκτωβρίου 2020, στη δέκατη επέτειό του, το HPP κυκλοφόρησε το πρώτο σχέδιο υψηλής αυστηρότητας που καλύπτει το 90.4% του ανθρώπινου πρωτεώματος (1). Αυτό βελτιώνει σημαντικά τις γνώσεις μας για την ανθρώπινη βιολογία και την κατανόηση των μοριακών μηχανισμών σε κυτταρικό και μοριακό επίπεδο, ειδικά τον ρόλο που διαδραματίζει το ανθρώπινο πρωτέωμα που οδηγεί άμεσα στη διεξαγωγή έρευνας και ανάπτυξης διαγνωστικών και θεραπευτικών μεθόδων για καρκίνους, καρδιαγγειακές και λοιμώδεις νόσους, ιδιαίτερα για εξατομικευμένες και ιατρική ακριβείας (4).
Η ανάπτυξη του Ανθρώπου Πρωτεΐνη Ο Atlas παρουσιάζει μια πολύ σημαντική πρόοδο για περαιτέρω έρευνα στον τομέα της ανθρώπινης διάγνωσης και θεραπείας (5,6).
***
αναφορές:
- HUPO 2021. Χρονοδιάγραμμα Proteomics. Διαθέσιμο σε https://hupo.org/Proteomics-Timeline.
- neXtProt 2021. Το ανθρώπινο πρωτέωμα. Διαθέσιμο online στο https://www.nextprot.org/about/human-proteome Πρόσβαση στις 30 Δεκεμβρίου 2020.
- Inserm, 2020. Proteomics: ο κώδικας της ζωής μεταφρασμένος κατά περισσότερο από 90%. Δημοσιεύτηκε 07 Δεκεμβρίου 2020. Διαθέσιμο στο διαδίκτυο στη διεύθυνση https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Πρόσβαση στις 30 Δεκεμβρίου 2020.
- Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW et al. 2020. Ένα σχέδιο υψηλής αυστηρότητας του ανθρώπινου πρωτεώματος. Δημοσιεύθηκε: 16 Οκτωβρίου 2020. Nature Communication 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9
- Digre A., and Lindskog C., 2020. The Human Protein Atlas – Spatial localization of the human proteome in health and disease. Protein Science Volume 30, Issue 1. Πρώτη δημοσίευση: 04 Νοεμβρίου 2020. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987
- The Human Protein Atlas 2020. Άτλας ανθρώπινης πρωτεΐνης Διαθέσιμο στο διαδίκτυο στη διεύθυνση https://www.proteinatlas.org/about Πρόσβαση στις 30 Δεκεμβρίου 2020.
***
