Έκφραση πρωτεϊνών αναφέρεται στη σύνθεση πρωτεϊνών μέσα στα κύτταρα χρησιμοποιώντας πληροφορίες που περιέχονται στο DNA ή στο γονίδιο.
Πρωτεΐνες είναι υπεύθυνες για όλες τις βιοχημικές αντιδράσεις που λαμβάνουν χώρα μέσα στο κύτταρο. Ως εκ τούτου, καθιστά απαραίτητη τη μελέτη της πρωτεϊνικής λειτουργίας για την κατανόηση των κυτταρικών διεργασιών.
Αυτό μελετάται επί του παρόντος με βάση τη χρήση φθοριζουσών πρωτεϊνών ως ετικετών. Ωστόσο, αυτό δεν παρέχει ανάλυση σε πραγματικό χρόνο, καθώς απαιτεί ωρίμανση του χρωμοφόρου που απαιτεί χρόνο και αυτό προκαλεί καθυστέρηση στη διερεύνηση της έκφρασης σε πραγματικό χρόνο, ειδικά για πρωτεΐνες που έχουν παροδικό ή εφήμερο χαρακτήρα.
Οι ερευνητές ανέφεραν μια νέα τεχνική σε διακομιστή προεκτύπωσης στις 30 Ιουλίου 2020, η οποία μπορεί να ξεπεράσει αυτόν τον περιορισμό.
Η νέα μελέτη περιγράφει τη χρήση ενός φθορίζοντος βιοαισθητήρα που επιτρέπει την ανίχνευση σε πραγματικό χρόνο της πρωτεϊνικής έκφρασης in vivo, η οποία έχει επιπτώσεις στην κατανόηση της χωροχρονικής έκφρασης των πρωτεϊνών στον ζωντανό οργανισμό. Αυτός ο αισθητήρας βασίζεται σε μια αμυδρή πράσινη φθορίζουσα πρωτεΐνη στην οποία ο προϋπάρχων φθορισμός αυξάνεται 11 φορές in vivo μετά την ειδική και ταχεία σύνδεση μιας ετικέτας πρωτεΐνης και επιτρέπει την ανίχνευση της έκφρασης πρωτεΐνης μέσα σε δευτερόλεπτα σε ζωντανά κύτταρα.
Αυτός ο διαλογισμός στα βιοαισθητήρας θα είναι χρήσιμο για τη μελέτη βιολογικών διεργασιών σε πραγματικό χρόνο όπου οι πρωτεΐνες είτε εκφράζονται παροδικά ή/και για την κατανόηση της έκφρασης και των αλληλεπιδράσεων των πρωτεϊνών από έναν οργανισμό που προκαλεί ασθένειες όπως τα βακτήρια ή ένας ιός με αυτόν των πρωτεϊνών ξενιστή.
Παραπομπή:
Eason MG., Pandelieva AT., Mayer MM., et al 2020. Γενετικά κωδικοποιημένος φθορίζων βιοαισθητήρας για ταχεία ανίχνευση πρωτεϊνικής έκφρασης. Προεκτύπωση: bioRxiv 2020.07.30.229633; DOI: https://doi.org/10.1101/2020.07.30.229633
***
